全額事業(yè)單位和差額事業(yè)單位的區(qū)別主要體現(xiàn)在含義、穩(wěn)定性以及包括范圍三個(gè)方面。全額撥款事業(yè)單位也稱為全供事業(yè)單位，是其所需的事業(yè)經(jīng)費(fèi)全部由國家預(yù)算撥款的一種管理形式;差額撥款事業(yè)單位，按差額比例，財(cái)政承擔(dān)部分，由財(cái)政列入預(yù)算;單位承擔(dān)部分，由單位在稅前列支，如醫(yī)院等。

穩(wěn)定性不同：對(duì)于全額事業(yè)單位而言，是相對(duì)穩(wěn)定，是基于跟著國家進(jìn)行調(diào)控，存在著一定的穩(wěn)定性;而差額事業(yè)單位存在的變動(dòng)可能性非常大，存在很大不確定的因素，因此也影響著工作的穩(wěn)定性。

涉及范圍不同：差額事業(yè)單位包括醫(yī)院等有收入的又承擔(dān)政府社會(huì)職能的單位;自收自支管理的事業(yè)單位，主要是一些原來國有企業(yè)的行業(yè)主管局;

全額撥款的事業(yè)單位主要有圖書館、文化館、各級(jí)公辦學(xué)校、黨校、檔案局、文化中心、農(nóng)業(yè)局下屬的森防管理事業(yè)單位、動(dòng)物疫病控制中心、城建局下城市維護(hù)管理的如園林處等內(nèi)容。